精靈的降臨
　　一天，「精靈族」從天上降臨到這個世界，他們利用神奇的機器與力量，一夕之間建立了一座巨大的城市，並在城市中心種植了一顆巨樹。精靈族嚴禁當時還過著部落生活的人類，進入這個新興的城市；但是，因迫于需要，于是開始雇用人類進入城市，爲他們提供勞動力。
　 生命之樹
　　精靈族將城市中的巨樹稱爲「生命之樹」，並禁止人類靠近！精靈利用連接于各個城市之間且盤根錯節的樹根，就像網絡般分享其研究的結果。
　　他們除了研究如何建立「空中之城」外，還從城市周遭獵捕動物和植物進行實驗，企圖秘密制造出特殊生命體，但研究效果卻不如預期，失敗的實驗生物常常趁機逃跑，而這些長相奇怪的實驗生物，被人類稱之爲「怪物」。
　 人類的掘起與災難之夜
　　半精靈是人類和精靈結合所誕生出來的種族。半精靈最大的特征，就是有著漂亮的外表和一雙尖尖的耳朵，而他們的壽命是人類的3 倍，只是半精靈的地位也和人類一樣，受到精靈族歧視，只能得到和怪物一樣的待遇。
　　這群長期被精靈欺壓的人類和半精靈，心中的仇恨也漸漸地強烈起來... 終于在某天清晨，半精靈與人類結盟，開始大肆攻擊精靈賴以維生的「生命之樹」，他們將其徹底的破壞，沒想到竟讓「生命之樹」爆炸了！
　　因爆炸所産生的巨大能量，喚醒了以「石化」狀態保存在研究室中的異變怪物，于是牠們開始在城市裏橫行霸道，肆無忌憚的破壞著；精靈們在無法阻擋這些怪物的行動下，竟舍棄了自己的城市家園，逃往了尚未開發完成的空中之城，而留下怪物、人類與半精靈在這塊土地上...
　 人類的王國
　　爲了躲避異變的怪物，人類和半精靈分別逃往了精靈族過去在各地建立的小城，並逐步地劃分出屬于自己的領地。而怪物們也不甘示弱，爲了擁有一塊棲身之地，也漸漸地聚集成爲一股勢力，與人類爭奪地盤。
　　其中一名曾經受到過精靈族青睐而接受洗禮的人類－巧夫，召集了部分有能力、有智慧的人類和半精靈人，以及願意追隨巧夫的人們，建立了「 馬吉利塔」王國。自此之後，其它有能力的人類和半精靈也隨之建立了魯狄斯... 等國家。從此「王國時代」便開始了...
　 ＭＩＸ
　　目前最讓巧夫國王感到頭痛的事情，就是城外的怪物不斷地威脅著馬吉利塔王國的安甯！直到有一天，有人想到曾經在精靈城裏見過能控制怪物的機器，因此提議再次進入精靈城尋找控制怪物的方法...
　　于是巧夫國王召集了王國裏的精英組成強大的軍隊，重返精靈城市。只是這支軍隊遭受到城中怪物們的頑強抵抗，能安然歸來的人寥寥無幾... 不過，他們還是帶回了部分機器和說明書。
　　于是人們開始按照說明書的方法制作機器，並成功制造出「寵物合成器」。這個機器不僅可以讓假死狀態下的「石化」怪物複活，被人類所馴服，還能將2 只不同的寵物加以合成，進化成全新、能力更爲強大的怪物! 這些利用機器所馴服的怪物，被稱爲「寵物」。
　　由于「寵物合成器」成功達到控制怪物的目的，英明的「巧夫」國王開始在城市中建立專門管理操作此機器的人和機構，只要通過相關的考試，就可獲得「合成管理員」的稱號和「許可證」。
　　此外，還鼓勵年輕的勇士接受打獵的訓練，取得「打獵許可證」和「獵人」的稱號。取得稱號的人們，擁有有狩獵怪物、攜帶、買賣寵物的權利 ，且有著不凡的地位。其中最頂尖的獵人，被稱爲「寵物合成大師」。
　 ＭＩＸ的傳播
　　寵物合成機器、合成管理員與獵人的設立，很快地被推廣到其它國家，各國的人們紛紛前往馬吉利塔學習。因爲這裏有位最早獲得打獵許可證，也是世界上最著名的獵人－馬吉利塔的國王「巧夫」。
　 黑暗森林和瘋狂的生命之樹
　　人類與怪物的戰鬥從未間斷，直到有一天，有個獵人在魯狄斯北部的黑暗森林發現了地獄，裏頭有棵瘋狂的生命之樹，不斷地産生強壯凶猛的怪物，于是獵人們團結一致，齊心協力爲鏟除這個破壞生態的生命之樹，開始了一段驚險的冒險...